Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
HDAC9Q9UKV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HDAC9Q9UKV0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HDAC9Q9UKV0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
HDAC9Q9UKV0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms