Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FBXW11Q9UKB1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FBXW11Q9UKB1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FBXW11Q9UKB1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FBXW11Q9UKB1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms