Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNOT8Q9UFF9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNOT8Q9UFF9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CNOT8Q9UFF9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CNOT8Q9UFF9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms