Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCNK4Q9NYG8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KCNK4Q9NYG8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KCNK4Q9NYG8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
KCNK4Q9NYG8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms