Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NECAP2Q9NVZ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NECAP2Q9NVZ3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms