Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSK7

C19orf12, Protein C19orf12, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C19orf12Q9NSK7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
C19orf12Q9NSK7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
C19orf12Q9NSK7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms