Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TNFRSF19Q9NS68 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TNFRSF19Q9NS68 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms