Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PAPOLBQ9NRJ5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PAPOLBQ9NRJ5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PAPOLBQ9NRJ5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PAPOLBQ9NRJ5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms