Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD1

FBXO6, F-box only protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO6Q9NRD1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO6Q9NRD1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
FBXO6Q9NRD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FBXO6Q9NRD1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FBXO6Q9NRD1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms