Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHST12Q9NRB3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHST12Q9NRB3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHST12Q9NRB3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CHST12Q9NRB3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms