Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCDC86Q9H6F5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCDC86Q9H6F5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC86Q9H6F5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms