Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6A0

DENND2D, DENN domain-containing protein 2D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2DQ9H6A0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DENND2DQ9H6A0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DENND2DQ9H6A0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DENND2DQ9H6A0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
DENND2DQ9H6A0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms