Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM5

YIPF3, Protein YIPF3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF3Q9GZM5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
YIPF3Q9GZM5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YIPF3Q9GZM5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YIPF3Q9GZM5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
YIPF3Q9GZM5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms