Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ6

EDEM3, ER degradation-enhancing alpha-mannosidase-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDEM3Q9BZQ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EDEM3Q9BZQ6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EDEM3Q9BZQ6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
EDEM3Q9BZQ6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms