Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CRNKL1Q9BZJ0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CRNKL1Q9BZJ0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CRNKL1Q9BZJ0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms