Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX2

TBC1D2, TBC1 domain family member 2A, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBC1D2Q9BYX2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
TBC1D2Q9BYX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TBC1D2Q9BYX2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
TBC1D2Q9BYX2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TBC1D2Q9BYX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TBC1D2Q9BYX2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TBC1D2Q9BYX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms