Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB11FIP5Q9BXF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB11FIP5Q9BXF6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms