Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VN1R3Q9BXE9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VN1R3Q9BXE9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VN1R3Q9BXE9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VN1R3Q9BXE9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms