Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC94Q9BW85 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC94Q9BW85 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC94Q9BW85 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.3 ms