Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW5

TIPIN, TIMELESS-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIPINQ9BVW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TIPINQ9BVW5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TIPINQ9BVW5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TIPINQ9BVW5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TIPINQ9BVW5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms