Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
THUMPD2Q9BTF0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
THUMPD2Q9BTF0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.08■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.73
THUMPD2Q9BTF0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
THUMPD2Q9BTF0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC32■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
THUMPD2Q9BTF0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms