Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP3BQ9BS92 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP3BQ9BS92 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
NIPSNAP3BQ9BS92 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NIPSNAP3BQ9BS92 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NIPSNAP3BQ9BS92 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NIPSNAP3BQ9BS92 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms