Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT9

GINS4, DNA replication complex GINS protein SLD5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS4Q9BRT9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GINS4Q9BRT9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GINS4Q9BRT9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
GINS4Q9BRT9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms