Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDNQ99608 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDNQ99608 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDNQ99608 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDNQ99608 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NDNQ99608 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDNQ99608 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDNQ99608 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDNQ99608 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDNQ99608 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDNQ99608 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDNQ99608 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDNQ99608 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDNQ99608 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDNQ99608 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDNQ99608 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDNQ99608 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDNQ99608 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDNQ99608 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDNQ99608 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NDNQ99608 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDNQ99608 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDNQ99608 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDNQ99608 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDNQ99608 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDNQ99608 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDNQ99608 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NDNQ99608 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDNQ99608 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDNQ99608 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDNQ99608 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDNQ99608 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDNQ99608 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDNQ99608 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDNQ99608 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDNQ99608 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NDNQ99608 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms