Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
SCAF11Q99590 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC35.89■■■■□ 3.34
SCAF11Q99590 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC35.85■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.33
SCAF11Q99590 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC35.79■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
SCAF11Q99590 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
SCAF11Q99590 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
SCAF11Q99590 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms