Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q11

TRNT1, CCA tRNA nucleotidyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNT1Q96Q11 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRNT1Q96Q11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRNT1Q96Q11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRNT1Q96Q11 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms