Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC16BQ96JE7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC16BQ96JE7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC16BQ96JE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.3 ms