Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC34Q96HJ3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCDC34Q96HJ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CCDC34Q96HJ3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC34Q96HJ3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms