Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
PGAP3Q96FM1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PGAP3Q96FM1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PGAP3Q96FM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms