Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SMIM12Q96EX1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SMIM12Q96EX1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SMIM12Q96EX1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms