Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LRRC39Q96DD0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRC39Q96DD0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRRC39Q96DD0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRRC39Q96DD0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms