Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TNPO1Q92973 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TNPO1Q92973 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TNPO1Q92973 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNPO1Q92973 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNPO1Q92973 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms