Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TSC1Q92574 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TSC1Q92574 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TSC1Q92574 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TSC1Q92574 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms