Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW34

TMEM239, Transmembrane protein 239, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM239Q8WW34 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TMEM239Q8WW34 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TMEM239Q8WW34 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM239Q8WW34 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms