Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW18

C17orf50, Uncharacterized protein C17orf50, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf50Q8WW18 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
C17orf50Q8WW18 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C17orf50Q8WW18 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C17orf50Q8WW18 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms