Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAX9

GSDMB, Gasdermin-B, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMBQ8TAX9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GSDMBQ8TAX9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSDMBQ8TAX9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSDMBQ8TAX9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms