Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP9

ZNF555, Zinc finger protein 555, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF555Q8NEP9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF555Q8NEP9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF555Q8NEP9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF555Q8NEP9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF555Q8NEP9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms