Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SPC24Q8NBT2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SPC24Q8NBT2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPC24Q8NBT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPC24Q8NBT2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms