Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
AVL9Q8NBF6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AVL9Q8NBF6 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AVL9Q8NBF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms