Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ANKRD53Q8N9V6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ANKRD53Q8N9V6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ANKRD53Q8N9V6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ANKRD53Q8N9V6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.5 ms