Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
C12orf29Q8N999 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
C12orf29Q8N999 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
C12orf29Q8N999 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
C12orf29Q8N999 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
C12orf29Q8N999 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C12orf29Q8N999 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
C12orf29Q8N999 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms