Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC89Q8N998 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC89Q8N998 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms