Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4A0

GALNT4, Polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALNT4Q8N4A0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GALNT4Q8N4A0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GALNT4Q8N4A0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
GALNT4Q8N4A0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GALNT4Q8N4A0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms