Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7G8

VPS13B, Vacuolar protein sorting-associated protein 13B, humanhuman

Predictions only

Length 4,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13BQ7Z7G8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VPS13BQ7Z7G8 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VPS13BQ7Z7G8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VPS13BQ7Z7G8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms