Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
USP30Q70CQ3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP30Q70CQ3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP30Q70CQ3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
USP30Q70CQ3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
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