Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC149Q6ZUS6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CCDC149Q6ZUS6 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CCDC149Q6ZUS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CCDC149Q6ZUS6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms