Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
C16orf54Q6UWD8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
C16orf54Q6UWD8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
C16orf54Q6UWD8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms