Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RTL6Q6ICC9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RTL6Q6ICC9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RTL6Q6ICC9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 151.5 ms