Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CREB3L3Q68CJ9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CREB3L3Q68CJ9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CREB3L3Q68CJ9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms