Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GARNL3Q5VVW2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GARNL3Q5VVW2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GARNL3Q5VVW2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms